恩施州水能资源丰富，理论蕴藏量为509万千瓦，可开发量为349.1万千瓦，至2002年底全州总装机47．6万千瓦。全州多年平均水资源总量为233亿立方米，人均拥有量达6000多立方米，多年平均降水量为1535毫米（折合水量367．5亿立方米），总承雨面积24061．25平方公里。全州河流众多，5000米以上的河流约400条，分属长江上游下段、清江、酉水、乌江、澧水5个水系，较大的河流有清江、酉水、唐岩河、郁江、娄水、沿渡河（神农溪）等。
　　清江源出利川市汪营镇上十庙，全长428公里，流域面积16714平方公里，州内河长278公里，控制面积10860平方公里，州内支流198条，较大的有忠建河、马水河、野三河、龙王河、带水河等。
　　酉水是元江支流，源出宣思县椿木营锣鼓圈，全长477公里，流域面积18530平方公里，州内长163公里，控制面积2687平方公里，州内支流47条，较大的有新峡河、老峡河等。
　　娄水为澧水支流，源出鹤峰县小圆乡里湾，全长256公里，流域面积5048平方公里，州内河长141公里，控制面积2939平方公里，州内支流43条，较大的有芭蕉河、湾潭河、大典河等。
　　唐崖河为乌江上游支流，全长249公里，流域面积5585平方公里，州内河长115公里，控制面积2512平方公里。州内支流43条，较大的支流有冷水河、南河、野猫河。
　　郁江是乌江上游支流，全长176公里，流域面积3800平方公里，州内河长88.00公里，控制面积1579平方公里。州内支流25条，较大的有官地坝河、四河头河等。
　　沿渡河又名神农溪，全长60.6公里，流域面积l047平方公里，支流26条，较大的有三道河、平阳河等。
　　截止2002年，全州已建成并登记注册的各类水库共214座，总蓄水量3.8亿立方米。大型水库1座：咸丰县境内的朝阳寺水库，库容1.l亿立方米。中型水库8座：恩施市车坝河水库，库容0.62亿立方米；利川市长顺水库、福宝山水库，库容分别为0.68、0.1亿立方米；建始县小溪口水库、四十二坝水库，库容分别为0.66、0.11亿立方米；来凤县新峡水库、塘口水库，库容分别为0.53、 0.39亿立方米；宣恩县龙洞水库，库容0.50亿立方米。小（I）型水库37座，小（Ⅱ）型水库170座。尚未登记分注册的中型水库5座，可蓄水2.2亿立方米。水库工程在本州是水利工程的骨干工程，具有防洪、灌溉、发电、供水、航运等多种功用。
　　州境属岩溶山区，地下水以河川基流量为主。全州地下水资源量多年均值为62．49亿立方米，类型主要为碳酸盐岩类岩溶水，补给主要由大气降水渗入为主，输出为河川基流、潜水蒸发和地下潜流。